现代社会发展快速，科技与网络也在不断地提高与更新。随着学术水平的不断提高，写作一篇优秀论文已成为大多数研究者的必修技能。然而，互联网时代的到来也带来了越来越多的学术不端行为，例如剽窃和抄袭等。因此，学术界对论文查重系统的需求愈发迫切。然而，随着时间的推移和人们的不断尝试，这些系统的方法和算法也逐渐提升。那么，这样的查重系统能否检测出已发表的论文呢？

首先，一个好的查重系统应该能够检测出论文的重复率。这种情况往往意味着存在剽窃或抄袭行为。大多数论文查重系统的方法是将待查内容与预先建立的参考文献比较，以此计算文献之间的相似度和重复率。这个过程中，包括引用内容的比对，也为检测已发表论文提供了基础。

其次，一个好的查重系统应该能够比较两篇论文的写作结构。这个结构可能并不太容易识别，但这是检测剽窃或抄袭的重要方法之一。事实上，许多论文的剽窃者经常会故意改变原文的一些细节来掩盖他们的行为，但对于那些文献分析方法流程先进的查重系统来说，这并不构成难题。

总的来说，论文查重系统中应用的算法和方法现已达到了前所未有的高度，并且能够有效地检测剽窃和抄袭行为，尽管存在一定的局限性和误报几率。这也意味着，在今后研究和学术写作中，确保诚信的方针与实践必将得到更加重视。